Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms