Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY9

DEPDC1B, DEP domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1BQ8WUY9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC1BQ8WUY9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms