Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms