Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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ZNF398Q8TD17 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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ZNF398Q8TD17 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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ZNF398Q8TD17 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF398Q8TD17 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF398Q8TD17 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF398Q8TD17 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF398Q8TD17 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF398Q8TD17 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF398Q8TD17 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF398Q8TD17 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF398Q8TD17 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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