Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms