Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms