Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms