Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3C3Q8NEB9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms