Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC21AQ8NDW8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC21AQ8NDW8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
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