Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARRDC4Q8NCT1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
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