Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KBTBD3Q8NAB2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KBTBD3Q8NAB2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KBTBD3Q8NAB2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KBTBD3Q8NAB2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KBTBD3Q8NAB2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KBTBD3Q8NAB2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KBTBD3Q8NAB2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms