Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSIP1Q8NA03 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms