Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAAF3Q8N9W5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAAF3Q8N9W5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms