Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME8Q8N427 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME8Q8N427 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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