Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTBP4Q8N2S1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTBP4Q8N2S1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTBP4Q8N2S1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTBP4Q8N2S1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTBP4Q8N2S1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTBP4Q8N2S1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTBP4Q8N2S1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTBP4Q8N2S1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTBP4Q8N2S1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTBP4Q8N2S1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTBP4Q8N2S1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTBP4Q8N2S1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTBP4Q8N2S1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTBP4Q8N2S1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LTBP4Q8N2S1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTBP4Q8N2S1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
LTBP4Q8N2S1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms