Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC47Q8N1G4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms