Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOT1Q8IXI2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms