Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOT2Q8IXI1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms