Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ6

TXNRD3, Thioredoxin reductase 3, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3Q86VQ6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TXNRD3Q86VQ6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNRD3Q86VQ6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms