Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms