Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBBP6Q7Z6E9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms