Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms