Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAD11Q709F0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAD11Q709F0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms