Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFX8Q6ZV50 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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