Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms