Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms