Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWU4

C6orf89, Bombesin receptor-activated protein C6orf89, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf89Q6UWU4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
C6orf89Q6UWU4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C6orf89Q6UWU4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C6orf89Q6UWU4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C6orf89Q6UWU4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C6orf89Q6UWU4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
C6orf89Q6UWU4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C6orf89Q6UWU4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C6orf89Q6UWU4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C6orf89Q6UWU4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C6orf89Q6UWU4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C6orf89Q6UWU4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C6orf89Q6UWU4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C6orf89Q6UWU4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C6orf89Q6UWU4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C6orf89Q6UWU4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C6orf89Q6UWU4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C6orf89Q6UWU4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms