Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
METAP1DQ6UB28 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms