Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms