Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHC4Q6S5L8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SHC4Q6S5L8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms