Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms