Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms