Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM88Q6PEY1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms