Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC27A1Q6PCB7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms