Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LLGL2Q6P1M3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LLGL2Q6P1M3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LLGL2Q6P1M3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LLGL2Q6P1M3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LLGL2Q6P1M3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LLGL2Q6P1M3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LLGL2Q6P1M3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LLGL2Q6P1M3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LLGL2Q6P1M3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LLGL2Q6P1M3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LLGL2Q6P1M3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LLGL2Q6P1M3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LLGL2Q6P1M3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LLGL2Q6P1M3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LLGL2Q6P1M3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LLGL2Q6P1M3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms