Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms