Protein–RNA interactions for Protein: Q68G75

LEMD1, LEM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1Q68G75 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LEMD1Q68G75 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LEMD1Q68G75 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms