Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALS2CLQ60I27 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALS2CLQ60I27 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms