Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
FOCADQ5VW36 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms