Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms