Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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LRRC38Q5VT99 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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