Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms