Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms