Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms