Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms