Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS7

GLE1, Nucleoporin GLE1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLE1Q53GS7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GLE1Q53GS7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLE1Q53GS7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms