Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms