Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP55Q53EZ4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms