Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3BQ502W6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms