Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms